Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
WhrnQ80VW5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WhrnQ80VW5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WhrnQ80VW5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WhrnQ80VW5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WhrnQ80VW5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WhrnQ80VW5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WhrnQ80VW5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WhrnQ80VW5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms