Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna12Q80SS5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms