Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClmQ7TSN2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ClmQ7TSN2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms