Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Kcnf1Q7TSH7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kcnf1Q7TSH7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnf1Q7TSH7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms