Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms