Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp397Q7TNK4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms