Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScocQ78YZ6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms