Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vma21Q78T54 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vma21Q78T54 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms