Protein–RNA interactions for Protein: Q71B07

Dpy19l3, Probable C-mannosyltransferase DPY19L3, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpy19l3Q71B07 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Dpy19l3Q71B07 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dpy19l3Q71B07 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms