Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp34Q6ZQ93 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp34Q6ZQ93 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms