Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube2oQ6ZPJ3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube2oQ6ZPJ3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms