Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tfap2eQ6VUP9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms