Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja6Q6S5G4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gja6Q6S5G4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gja6Q6S5G4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms