Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b4Q6Q477 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b4Q6Q477 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms