Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp1a2Q6PIE5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1a2Q6PIE5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1a2Q6PIE5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms