Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip4Q6PHZ8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms