Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Znf316Q6PGE4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Znf316Q6PGE4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf316Q6PGE4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms