Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtifQ6PEE2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
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