Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc36Q6PDM4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms