Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Dtx4Q6PDK8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dtx4Q6PDK8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms