Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atl2Q6PA06 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Atl2Q6PA06 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms