Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fhod1Q6P9Q4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fhod1Q6P9Q4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fhod1Q6P9Q4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fhod1Q6P9Q4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms