Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hdac10Q6P3E7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac10Q6P3E7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1139.3 ms