Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpbp1l1Q6NZP2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms