Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rprd2Q6NXI6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rprd2Q6NXI6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms