Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Colgalt2Q6NVG7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colgalt2Q6NVG7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms