Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cpsf6Q6NVF9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 262.5 ms