Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HelbQ6NVF4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HelbQ6NVF4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms