Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc66Q6NS45 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc66Q6NS45 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms