Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep78Q6IRU7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cep78Q6IRU7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms