Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms