Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm4Q6IRU2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tpm4Q6IRU2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms