Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Smarca2Q6DIC0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Smarca2Q6DIC0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Smarca2Q6DIC0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Smarca2Q6DIC0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms