Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2cQ69ZS6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sv2cQ69ZS6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sv2cQ69ZS6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms