Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzrn3Q69ZS0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
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