Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rapgefl1Q68EF8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgefl1Q68EF8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms