Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab3ipQ68EF0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms