Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Sbno1Q689Z5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sbno1Q689Z5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Sbno1Q689Z5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms