Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Zfp248Q640N4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Zfp248Q640N4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Zfp248Q640N4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Zfp248Q640N4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Zfp248Q640N4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Zfp248Q640N4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Zfp248Q640N4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp248Q640N4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Zfp248Q640N4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Zfp248Q640N4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Zfp248Q640N4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Zfp248Q640N4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp248Q640N4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp248Q640N4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp248Q640N4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Zfp248Q640N4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp248Q640N4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp248Q640N4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp248Q640N4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zfp248Q640N4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp248Q640N4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp248Q640N4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp248Q640N4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp248Q640N4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zfp248Q640N4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp248Q640N4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms