Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfe3Q64092 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfe3Q64092 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms