Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Itga3Q62470 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms