Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vil1Q62468 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vil1Q62468 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vil1Q62468 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vil1Q62468 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vil1Q62468 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vil1Q62468 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vil1Q62468 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vil1Q62468 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms