Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcncQ62447 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcncQ62447 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcncQ62447 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcncQ62447 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcncQ62447 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms