Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa13Q62424 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms