Protein–RNA interactions for Protein: Q62406

Irak1, Interleukin-1 receptor-associated kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irak1Q62406 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irak1Q62406 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irak1Q62406 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms