Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpd52Q62393 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms