Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf6Q62311 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf6Q62311 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms