Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six2Q62232 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six2Q62232 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six2Q62232 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Six2Q62232 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six2Q62232 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six2Q62232 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Six2Q62232 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Six2Q62232 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Six2Q62232 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms