Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd180Q62192 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd180Q62192 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms