Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Ttf1Q62187 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Ttf1Q62187 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Ttf1Q62187 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ttf1Q62187 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ttf1Q62187 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf1Q62187 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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